A estrutura de funcionamento da Igreja Evangélica de Confissão Luterana no Brasil tem um caráter participativo nos mais diversos níveis (comunitário, paroquial, sinodal e nacional). Milhares de pessoas são eleitas em assembléias comunitárias, paroquiais e sinodais. Elas compõem conselhos e diretorias nos diversos níveis.

Para poderem desempenhar da melhor forma possível as suas funções são organizados seminários de presbíteros/as ou cursos de lideranças. Nestes eventos são aprofundados os aspectos bíblico-teológicos que embasam as funções e são repassadas informações importantes sobre a dinâmica de funcionamento da Igreja. As pessoas são inteiradas dos trâmites de processos e recebem informações sobre a legislação civil e tributária.