O Sínodo da Amazônia reune-se anualmente em Assembleia Sinodal com o objetivo de aprovar o plano de objetivos e metas da missão da IECLB na área do Sínodo; promover a reflexão e o debate sobre os temas fundamentais da igreja e os de interesse das Comunidades, Paróquias e do Sínodo; incentivar e promover, entre as Comunidades do Sínodo, a comunhão e o compartilhamento de experiências de fé e de trabalho; eleger a liderança ministerial e administrativa do Sínodo e indicar candidatos e candidatas para os cargos diretivos nacionais.
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